독감 예방접종은 생후 6개월부터 14세까지 어린이, 임신부, 65세 이상 어르신, 함안군민 가운데 별도 대상자를 대상으로 진행된다. 어린이는 접종 이력에 따라 2회 접종 대상자는 2026년 9월 21일부터 2027년 4월 30일까지, 1회 접종 대상자는 2026년 9월 28일부터 2027년 4월 30일까지 접종할 수 있다. 임신부의 접종 기간도 2026년 9월 21일부터 2027년 4월 30일까지다. 어르신은 연령에 따라 접종 시작일이 다르다. 75세 이상은 2026년 10월 12일부터, 70세부터 74세까지는 10월 15일부터, 65세부터 69세까지는 10월 19일부터 접종이 가능하며, 각 대상의 접종 기간은 2027년 4월 30일까지다. 함안군민인 65세 이상 어르신은 10월 12일부터 연령별 기간과 관계없이 접종할 수 있다. 함안군민을 대상으로 한 독감 예방접종은 함안군 보건소에서만 시행한다. 심한 장애인, 기초생활수급자, 국가유공자, 다문화 결혼 이민자는 무료 대상이며, 15세부터 64세까지 함안군민은 선착순으로 유료 접종을 받을 수 있다. 비용은 9,000원이다. 코로나19 예방접종은 65세 이상 어르신과 면역저하자, 감염취약시설 입원·입소자를 대상으로 한다. 어르신의 접종 시작일은 독감 예방접종과 같으며, 접종 기간은 2027년 4월 30일까지다. 면역저하자와 감염취약시설 입원·입소자는 2026년 10월 12일부터 2027년 6월 30일까지 접종할 수 있다. 지자체 사업 대상자를 제외한 코로나19 예방접종 대상자는 전국 보건기관과 위탁의료기관에서 접종할 수 있다. 함안군 보건소는 월요일, 수요일, 목요일, 금요일에 접종을 진행하며, 보건지소와 진료소, 위탁의료기관은 전화로 일정을 확인한 뒤 방문해야 한다.